Многое, чему учили в школе, приходилось осваивать, по сути, заново. Поэтому в марте Анатолий подал документы для поступления на подготовительные курсы в Минский педагогический институт имени М. Горького. Трудно далось это решение: Анатолий понимал, что нелёгкая жизнь семьи без его помощи станет ещё тяжелее. и ему предстоят серьёзные материальные трудности в случае поступления в институт. Тяга к учению взяла верх, на семейном совете мать и сёстры настояли на том, чтобы сын и брат продолжил обучение. Так Анатолий первого сентября 1946 года стал студентом первого курса исторического факультета Минского педагогического института.
Нельзя сказать, что учёба легко давалась студенту. Сказывался и перерыв в обучении, и то, что базовые знания, полученные в сельской школе, были не очень основательными. Да и материальное положение было тяжёлым. Родные при всём желании не могли помочь, продуктов в то время не хватало и на селе, еле сводили концы с концами. Хорошо, что не оставляли без внимания родственники, помогали чем могли. Поддерживал в основном старший брат Иван, до войны работавший в Белостоке. Вернувшись с фронта, он забрал свою семью, которая в первые дни войны эвакуировалась с Белостока, и работал в Гомельской области. Выручала Анатолия стипендия, пусть и небольшая.
Жил студент Якимович в общежитии пединститута по улице Кирова. Недалеко, в общежитии педагогического техникума, жила его двоюродная сестра Аня, тоже студентка. Так и жили, помогая друг другу. Только-только, в 1947 году, отменили карточки. Это и радовало — экономика стала укрепляться, и огорчало — цены стали расти. Не оставляло бывшего воина и руководство института. Понимая его сложное финансовое положение, ректорат, профком учебного заведения периодически оказывали Якимовичу материальную помощь. Тем не менее студенческие годы остались в памяти Анатолия Климентьевича как лучшие годы жизни. Было трудно, голодно, порой не хватало времени, ведь студенты кроме учёбы в свободное время разбирали завалы кирпичей полуразрушенного Минска, помогали отстраивать свою столицу.