В это драматическое для всей страны время епископа Амвросия арестовали в обители и вывезли вместе с келейником Иовом (Протопоповым, расстрелянным в 1930 году) на станцию Тюрлема Московско-Казанской железной дороги. Там из штаба 5‑й армии, стоявшего в вагонах поезда Троцкого, владыку вывели в поле, а келейника отпустили, запретив ему следовать за епископом.
Через несколько часов келейник нашёл тело владыки Амвросия, брошенное лицом вниз, проткнутое штыком в спину насквозь, с вывернутыми при жизни обеими руками. Верный келейник похоронил владыку на месте мученической смерти.
Новомученик епископ Амвросий (Василий Гудко) погиб, борясь за души верующих, призывая отринуть воцарившиеся ложь и безбожие, не поддаваться соблазнам порока. До последней минуты он верно служил Богу, православной церкви и народу, оплакивал горькую судьбу Отечества и императора — помазанника Божия. Погиб с молитвой на устах, повторив жизненный подвиг своего земляка и духовного учителя преподобномученика Афанасия Брестского.
14 июня 2018 года по благословению Патриарха Московского и всея Руси Кирилла в месяцеслов внесено празднование Собора святых
Удмуртской земли в составе 12 человек. Возглавляет список новомученик, священномученик епископ Сарапульский Амвросий. Он был причислен к лику новомучеников и исповедников российских на Архиерейском соборе Русской православной церкви в августе 2000 года.
Сегодня память о владыке Амвросии бережно хранят верующие города Сарапула. Его образ почитается в храмах, где перед ним возносятся молитвы о заступничестве и помощи. В память о святом совершаются молебны, а ежегодно 9 августа (27 июля по ст. ст.), в день его мученической кончины, в Покровском кафедральном соборе Сарапула при большом стечении верующих проходят торжества. Божественную литургию совершают архипастыри Удмуртской митрополии и приглашённые архиереи из других регионов России.
Преподобный епископ Сарапульский Амвросий, словно свет маяка, указывал заблудшим душам путь к спасению из пучины грехов человеческих. Продолжает он это делать и после жизни земной, ибо подвиг его во славу Божию живёт в народной памяти как образец служения православной вере, Отечеству и ближнему своему.
Город Ижевск,
25 января 2025 года